Moto Hagio debutta appena ventenne nel 1969 con la storia breve Lulu to Mimi nella rivista Nakayoshi di Kodansha. Con Shogakukan disegna molte storie brevi per diverse riviste. Due anni dopo il suo debutto pubblica Juichigatsu no Gimunajiumu una storia breve che tratta apertamente la storia d'amore tra due ragazzi in collegio.
Nel 1974 sviluppa il tema nella storia più lunga Toma no Shinzo (Il Cuore di Thomas) e insieme ad altre autrici che verranno poi identificate come Gruppo 24 si fa pioniera di un movimento che ridefinisce lo shoujo e getta le basi per i boy's love. Nel 1976 Moto Hagio viene premiata con lo Shogakukan Manga Award per il suo fantascientifico Juichinin Iru! (Siamo in 11!) e Poe no Ichizoku (Il Clan dei Poe), entrambi pubblicati in Italia.
Nel 2022 viene inserita nella Will Eisner Comic Awards Hall of Fame.
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